پایان نامه : کلونینگ و بیان ژن آنزیم ال-آسپاراژیناز باکتری E. coli جهش یافته … |
…………………………………………………………………………………………………………………………………….. 1
مقدمه ………………………………………………………………………………………………………………………………………..3
فصل اول کلیات …………………………………………………………………………………………………….. 5
1-1-پیشینه تاریخی ………………………………………………………………………………………………………………….. 6
1-2-آماده سازی ال-آسپاراژیناز قابل استفاده برای درمان ……………………………………………………………… 8
1-3- آزمایش های بالینی با ال-آسپاراژیناز ……………………………………………………………………………….. 10
1-4-خصوصیات شیمیایی و داروشناسی این دارو ………………………………………………………………………. 12
1-4-1 اثر ضد سرطانی ………………………………………………………………………………………………………….. 12
1-4-2- ترکیبات شیمیایی داروی در دسترس برای درمان …………………………………………………………… 14
1-4-2-1 آنزیم طبیعی ……………………………………………………………………………………………………………. 14
1-4-2-2-آنزیم تغییریافته ………………………………………………………………………………………………………. 16
1-5- فارماکوکنتیک ……………………………………………………………………………………………………………….. 19
1-5-1- مقاومت دارویی ………………………………………………………………………………………………………… 23
1-5-2- تأثیر دارویی ………………………………………………………………………………………………………….. 25
1-6-سمیّت ………………………………………………………………………………………………………………………… 28
فصل دوم روش کار …………………………………………………………………………………………… 34
2-1- مواد و میکروارگانیسم ها ……………………………………………………………………………………………….35
2-2- کشت باکتری ……………………………………………………………………………………………………………… 35
2-3- اعمالUV در زمان های مختلف …………………………………………………………………………………… 35
2-4- انجام تستNesslerizationبه منظور بررسی مقدار آمونیاک آزاد شده ..……………………….. 36
2-4-1- کشت کلنی ها ……………………………………………………………………………………………………….. 36
2-4-2- تعیین غلظت آمونیاک آزاد شده در محلول واکنش توسط ال-آسپاراژیناز کلنی ها …………… 37
2-4-3- محلول های لازم برای سنجش میزان فعالیت آنزیم ال-آسپاراژیناز کلنی ها ……………………. 38
2-5-استخراجDNA…………………………………………………………………………………………………………. 40
2-5-1- کشت باکتری به منظور استخراج DNA…………………………………………………………………….. 40
2-5-2- استخراج DNA ژنومی ……………………………………………………………………………………………. 41
2-6- واکنش زنجیره ای پلیمراز(PCR) ………………………………………………………………………………. 42
2-7- الکتروفورز بر روی ژل آگارز ……………………………………………………………………………………. 43
2-8- خالص سازی محصول PCR …………………………………………………………………………………….. 44
2-9- استخراج پلاسمید ……………………………………………………………………………………………………. 46
2-10- هضم آنزیمی و کلون کردن قطعه در داخل وکتور ……………………………………………………… 47
2-10-1- الگوی برش آنزیمی ژن ال-آسپاراژیناز ll …………………………………………………………….. 47
2-10-2- برش و آماده سازی وکتور pET23a(+) ……………………………………………………………… 48
2-10-3- واکنش الحاق وکتور pET23a(+) با قطعه ژنی ال-آسپاراژینازll ……………………………. 48
2-11-ایجاد سلول های Competant و انتقال پلاسمید …………………………………………………….. 49
2-12-انتخاب کلون های مثبت …………………………………………………………………………………………. 50
2-13- تأیید کلنی های نوترکیب باPCRو هضم آنزیمی …………………………………………………….. 51
2-13-1-PCR ……………………………………………………………………………………………………………….. 51
2-13-2- هضم آنزیمی ……………………………………………………………………………………………………. 52
2-14- بیان و استخراج پروتئین بیان شونده توسط ژن آنزیم ال-آسپاراژینازll …………………………. 53
2-14-1- القاء بیان پروتئین آنزیمی ال-آسپاراژیناز ll…………………………………………………………… 53
2-14-2- استخراج پروتئین های آنزیمی ال-آسپاراژیناز ll و ال-آسپاراژیناز l ………………………… 54
2-15- بررسی اولیه بیان پروتئین نوترکیب ال-آسپاراژیناز ll و پروتئین ال-آسپاراژیناز l با SDS-
PAGE …………………………………………………………………………………………………………………………… 55
2-16- تعیین فعالیت آنزیمی یا فعالیت کلّی( IU ) آنزیم های ال-آسپاراژیناز …………………………. 58
2-17- تعیین پروتئین کلّی ( mg ) آنزیم های ال-آسپاراژیناز ……………………………………………….. 59
2-18- تعیین فعالیت ویژه( IU/mg ) آنزیم های ال-آسپاراژیناز ………………………………………….. 62
2-19- کشت سلول انسانی ………………………………………………………………………………………………. 62
2-19-1- تهیه محیط كشت RPMI1640…………………………………………………………………………. 63
2-20- تاثیر آنزیم ال-آسپاراژینازll(نوترکیب)،ال-آسپاراژینازlو آنزیم استاندارد بر سلول های
سرطانی انسانی ………………………………………………………………………………………………………………. 63
2-20-1- MTT Assay …………………………………………………………………………………………………. 63
2-21- تست تغییرات سیتوپلاسمی سلول های سرطانی بعد از انجام تست MTT …………………… 65
فصل سوم نتایج …………………………………………………………………………………………….. 67
3-1- بررسی و شماره گذاری کلنی ها ………………………………………………………………………………. 68
3-2- نتایج اعداد جذب محلول های استاندارد سولفات آمونیوم در طول موج nm490 …………… 69
3-3- بررسی اعداد جذب آمونیاک آزاد شده در محلول های به دست آمده از کلنی های جهش
یافته ……………………………………………………………………………………………………………………………… 70
3-4- جداسازی و تکثیر ژن آنزیم ال-آسپاراژیناز ll ……………………………………………………………. 72
3-5- تعیین توالی قطعه ژنیl-aspsraginase ll…………………………………………………………….. 74
3-6- وارد کردن قطعه ژنیl-asparaginase ll در وکتور pET23a و تأیید آن …………………. 76
3-7- نتیجه SDS-PAGE نمونه های آنزیمی ال-آسپاراژیناز ll , l و استاندارد ………………………… 79
3-8- محاسبۀ فعالیت آنزیمی(IU) ال-آسپاراژینازll نوترکیب، ال-آسپاراژینازl و ال-آسپاراژیناز
استاندارد ……………………………………………………………………………………………………………………….. 80
3-9- تعیین پروتئین کلّی (mg) آنزیم های ال-آسپاراژینازll نوترکیب، ال-آسپاراژینازl و ال-
آسپاراژیناز استاندارد ………………………………………………………………………………………………………… 82
3-10- تعیین فعالیت ویژه( IU/mg ) آنزیم های ال-آسپاراژینازll نوترکیب، ال-آسپاراژینازl و
ال-آسپاراژیناز استاندارد ………………………………………………………………………………………………….. 84
3-11- بررسی تأثیر آنزیم ال-آسپاراژینازll (نوترکیب)، ال-آسپاراژینازl و آنزیم استاندارد بر سلول
های سرطانی HeLa ………………………………………………………………………………………………………. 85
3-12- بررسی تأثیر آنزیم ال-آسپاراژینازll (نوترکیب)، ال-آسپاراژینازl و آنزیم استاندارد بر سلول
های سرطانی LCL ……………………………………………………………………………………………………….. 89
3-13- بررسی تغییرات سیتوپلاسمی سلول های سرطانی بعد از انجام تست MTT ………………… 97
فصل چهارم بحث و پیشنهادات ………………………………………………………………………. 98
منابع …………………………………………………………………………………………………………………………….. 108
فرم در حال بارگذاری ...
[چهارشنبه 1399-10-17] [ 10:11:00 ق.ظ ]
|