دانلود پایان نامه:جداسازی و شناسایی مولکولی باکتریهای اندوفتیک گیاه گندم و بررسی اثرات آنتاگونیسمی آنها علیه پاتوژنهای قارچی گیاه |
2-3- اندوفیت و کلونیزاسیون ………………………………………………………………………………… 18
2-4- باکتریهای اندوفتیک و کاربرد آنها……………………………………………………………………. 21
2-4-1- افزایش تولید هورمونهای گیاهی……………………………………………………………………. 21
2-4-2- تثبیت بیولوژیکی نیتروژن……………………………………………………………………………… 25
2-4-3- فیتوبیورمیدیشن………………………………………………………………………………………….. 28
2-4-4- انحلال فسفات…………………………………………………………………………………………… 39
2-4-5- تولید سیدروفور……………………………………………………………………………………………. 41
2-4-6- تولید آنتیبیوتیک و آنتیبیوزیس………………………………………………………………………. 44
2-5- باکتریهای اندوفتیک و تولید آنزیم……………………………………………………………………….. 51
2-6- تنوع و جمعیت میکروارگانیسمهای یافت شده بهعنوان اندوفتیک………………………………….. 53
فصل سوم (مواد و روشها)
3-1- جداسازی و کشت باکتری اندوفتیک………………………………………………………………………. 59
3-1-1- مواد و وسایل لازم جهت جداسازی و کشت باکتریهای اندوفتیک از گیاهگندم……………. 59
3-1-2- روش کار……………………………………………………………………………………………………. 59
3-1-2-1- نمونه و نمونهگیری…………………………………………………………………………………….. 59
3-1-2-2- کشت و شناسایی………………………………………………………………………………………. 60
3-2-شناسایی فنوتیپی باکتریهای اندوفتیک…………………………………………………………………….. 60
3-2-1-رنگآمیزی گرم…………………………………………………………………………………………….. 60
3-2-2- تست کاتالاز……………………………………………………………………………………………….. 61
3-2-3- تست سیتوکروماکسیداز………………………………………………………………………………….. 61
3-2-4- تست کوآگولاز…………………………………………………………………………………………….. 61
3-2-5- تست حرکت………………………………………………………………………………………………. 62
3-2-6- تست هیدرولیزژلاتین…………………………………………………………………………………….. 62
3-2-7- تست سیمونسیترات……………………………………………………………………………………… 63
3-2-8- تستMR/VP………………………………………………………………………………………………….63
3-2-9- تست هیدرولیزنشاسته……………………………………………………………………………………. 63
3-2-10- تست هیدرولیزکازئین………………………………………………………………………………….. 64
3-3- شناسایی باکتریهای تولیدکننده ترکیبات ضدقارچی به روش مولکولار…………………………… 64
3-3-1- مواد و وسایل مورد استفاده جهت استخراجDNA…………………………………………………64
3-3-2- روش استخراجDNAژنومی…………………………………………………………………………… 65
3-3-3- روش تهیه ژل آگارز یک درصد……………………………………………………………………….. 65
3-3-4- انجامPCR………………………………………………………………………………………………………….. 66
3-3-4-1- وسایل مورد استفاده برای انجام PCR و شرایط دمایی دستگاه ترموسایکلر……………… 66
فصل چهارم (نتایج و بحث)
4-1- جداسازی باکتریهای اندوفتیک از گیاهگندم…………………………………………………………….. 67
4-2- شناسایی فنوتیپی باکتریهای اندوفتیک 68
4-3- ارزیابی اثر آنتاگونیسمی باکتریهای اندوفتیک برعلیه قارچهای بیوکنترلی و قارچهای پاتوژن
گیاهی……………………………………………………………………………………………………………………. 70
4-4- بررسی فعالیت آنزیمβ-1و4گلوکاناز……………………………………………………………………. 76
4-4-1- مواد و وسایل لازم………………………………………………………………………………………… 76
4-4-2- روش تهیه محلول نمکی 1مولار………………………………………………………………………. 76
4-4-3- ترکیبات محیطCMCآگار1%…………………………………………………………………………… 77
4-4-4 معرف آزمایش کنگورد…………………………………………………………………………………….. 77
4-4-5 کشت و بررسی……………………………………………………………………………………………… 77
4-5- نتایج مربوط به شناسایی مولکولی باکتریها……………………………………………………………… 77
4-5-1- آنالیز کیفی محصولاتPCR……………………………………………………………………………78
4-5-2- نتایج تعیین توالی………………………………………………………………………………………….. 78
فصل پنجم (نتیجه گیری)
5-1. نتیجه گیری……………………………………………………………………………………………………… 92
5-2پیشنهادات…………………………………………………………………………………………………………. 98
منابع و ماخذ……………………………………………………………………………………………………………. 99
چکیده انگلیسی…………………………………………………………………………………………………………. 109
فهرست جداول
عنوان جدول صفحه |
جدول2-1. مشخصههایی از بیماری زنگ…………………………………………………………………………………………5 |
جدول2-2. مشخصههایی از بیماری سیاهک……………………………………………………………………………………..6 |
جدول2-3. انواع میکوتوکسین فوزاریومی……………………………………………………………………………………….12 |
جدول2-4. انواع ترشحات ریشه……………………………………………………………………………………………………18 |
جدول2-5. اندوفیتیکهای تثبیتکننده نیتروژن………………………………………………………………………………..28 |
جدول2-6. میکروارگانیسمهای مولد اسیدآلی………………………………………………………………………………….32 |
جدول2-7. میکروارگانیسمهای مولد بیوسورفاکتانت………………………………………………………………………..33 |
جدول2-8. میکروارگانیسمهای مولد گلیکوپروتئین………………………………………………………………………….34 |
جدول2-9. میکروارگانیسمهای اکسیدکننده و احیاءکننده…………………………………………………………………..35 |
جدول2-10. میکروارگانیسمهای دخیل در فیتوبیورمیدیشن……………………………………………………………….39 |
جدول2-11. میکروارگانیسمهای مولد سیدروفور…………………………………………………………………………….43 |
جدول2-12. اندوفیتهای مولد آنتیبیوتیک و عملکرد آنها……………………………………………………………..50 |
جدول3-1. شرایطPCR……………………………………………………………………………………………………………….66 |
جدول3-2. چرخهPCR………………………………………………………………………………………………………………..66 |
جدول3-3. توالی پرایمرطراحی شده برای16S rRNA………………………………………………………………………66 |
جدول4-1. نتایج آزمونهای بیوشیمیایی…………………………………………………………………………………………68 |
جدول4-2. اسامی قارچهای مورد آزمون………………………………………………………………………………………..71 |
جدول4-3. نتایج آنتاگونیسمی برعلیهFusarium moniliforme………………………………………………………..72 |
جدول4-4. نتایج آنتاگونیسمی برعلیهFusarium graminearum……………………………………………………..72 |
جدول4-5. نتایج آنتاگونیسمی برعلیهFusarium oxysporum…………………………………………………………..72 |
جدول4-6. نتایج آنتاگونیسمی برعلیهFusarium culmorum…………………………………………………………..72 |
جدول4-7. نتایج آنتاگونیسمی برعلیهTricoderma virida………………………………………………………………73 |
جدول4-8. نتایج آنتاگونیسمی برعلیهTricoderma harizanum……………………………………………………….73 |
جدول4-9. نتایج آنتاگونیسمی برعلیه.Tricoderma asperellum………………………………………………………73 |
جدول4-10. نتایج آنتاگونیسمی برعلیهMacrophomina phaseolina………………………………………………73 |
جدول4-11. ترکیبات محیطCMCآگار1%……………………………………………………………………………………..76 |
جدول4-12. نتایجBlast……………………………………………………………………………………………………………..79 |
فهرست شکلها
ی نوشتهها
فرم در حال بارگذاری ...
[چهارشنبه 1399-10-17] [ 12:30:00 ق.ظ ]
|