پایان نامه ارشد:مطالعه تئوری بر روی توتومریهای زانتین و بر همکنش این مولکول با آب و … |
………………………………………………………………………………………… 12
1-5-1- مجموعههای پایه زتای دوگانه و پایه زتای سه گانه…………………………………………………………………………………………………….. 13
1-5-2- مجموعه پایه قطبیده…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 13
1-6- هدف………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 14
فصل دوم: بخش نظری
2-1- روش های محاسباتی………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 16
2-3- فلسفه تئوری Gaussian 09………………………………………………………………………………………………………………………………………………………. 17
2-4- محاسبات در فاز حلال…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 18
فصل سوم: بحث و نتیجه گیری
3-1- مقدمه……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 18
3-2- بحث و نتیجه گیری…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 18
3-2-1- بررسی حالت گازی…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 20
3-3- بررسی پایداری توتومرها در حالت گازی…………………………………………………………………………………………………………………………………… 20
3-4- بررسی ساختار توتومرها در حالت گازی…………………………………………………………………………………………………………………………………… 23
3-5- بررسی پایداری توتومرها در حلال……………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 26
3-6- اثر ویژه حلال……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 28
3-6-1- بررسی پایداری و ساختار………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 28
3-7- بررسی محاسبات NBO و Mulikenدر نه توتومر زانتین با استفاده از روش DFT و MP2 در فاز گازی 40
3-8- حالت گذار…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 46
3-9- بررسی اوربیتال های HOMO و LUMO…………………………………………………………………………………………………………………………… 48
3-10- نمایش اوربیتال های HOMO و LUMO……………………………………………………………………………………………………………………….. 50
3-11- بررسی طول پیوند برای پایدارترین توتومر با یون های مختلف………………………………………………………………………………………. 52
3-12- نتیجه گیری……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 55
مراجع:………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….. 20
فهرست جدولها
عنوان و شماره صفحه
جدول 3-1: انرژی کل محاسبه شده، پایداری نسبی و دادههای ترمودینامیکی ایزومرهای مختلف زانتین با روشهای DFT و MP2 و سطح پایه 6-311++G(d,p). 21
جدول 3-2: طول پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روش DFT با مجموعه پایه 6-311++G(d,p) در حالت گازی 23
جدول3-3: طول پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روش MP2 با مجموعه پایه 6-311G(d,p) در حالت گازی 24
جدول 3-4: زاوایای پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روش DFT با مجموعه پایه 6-311++G(d,p) در حالت گازی 25
جدول 3-5: زوایای پیوند ایزومرهای A-I زانتین محاسبه شده با روشهای MP2 با مجموعه پایه 6-311G(d,p) در حالت گازی 26
جدول 3-6: پایداری نسبی و ممانهای دو قطبی ایزومرهای زانتین در حالت گازی و حلال محاسبه شده با روش DFT و MP2 با مجموعههای پایه 6-311++G(d,p) و 6-311G(d,p). 27
جدول 3-7: انرژی نسبی، استحکام باند و فاصله پیوند هیدروژنی برای توتومرهای زانتین با روش DFT و مجموعه پایه 6-311++G(d,p) 35
جدول 3-8: محاسبه انرژی فعال سازی و انرژی آزاد نسبی بر حسب کیلو کالری بر مول برای توتومرهای زانتین با استفاده از یک مولکول آب با روش DFT و مجموعه پایه B3LYP/6-311++G(d,p). 36
جدول 3-9: محاسبه تغییرات NBO در اتم برای توتومرهای زانتین با روشهای DFT و MP2 در دو فاز گازی و حلال 40
جدول 3-10: محاسبه تغییرات Muliken در اتم برای توتومرهای زانتین با در روشهای DFT و MP2 در دو فاز گازی و حلال 43
جدول3-11: انرژی فعالسازی و انرژی آزاد نسبی بر حسب کیلو کالری بر مول برای توتومرهای زانتین محاسبه شده با B3LYP/6-311++G(d,p) 46
جدول3-12: پارامترهای انرژی توتومرهای زانتین به روش DFT در فاز گازی بر حسب (ev). 49
جدول 3-13: بررسی طول پیوند پایدارترین توتومر زانتین با یونهای مختلف با روش DFT و سطح پایه 6-311++G(d,p). 52
فهرست شکل ها
عنوان و شمارهصفحه
شکل 1-1: ساختار برخی از پورینها 3
فرم در حال بارگذاری ...
[سه شنبه 1399-10-16] [ 11:09:00 ب.ظ ]
|